تسعى مدارس البحار الأهلية إلى تنشئة طالبات متميزات علميًا، ملتزمات دينيًا، ومؤهلات بمهارات التعلم الذاتي وحل المشكلات، مع التركيز على البحث العلمي والتقنية الحديثة. تهدف المدرسة إلى إعداد جيل قادر على استكشاف الأفكار الجديدة واتخاذ القرارات المهمة، مع الالتزام بخدمة المجتمع.